主要解决的问题主要有两个：一是异质性（heterogeneity），比如a）鉴定某些因为含量（比例）较低而在常规RNA测序检测时被“掩盖”的细胞亚群；b) 检测细胞群体中不同的个体细胞：比如

单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq)是在单个细胞水平对mRNA进行高通量测序的一项新技术，原理是将分离的单个细胞中微量的mRNA通过高效扩增后再进行高通量测序。

单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两个方面，分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。

流式细胞术作为一种可在单细胞水平上对大量细胞进行快速、准确、多参数定量分析和分选的高技术；进行流式细胞术分析的前提是样品为单细胞悬液，根据不同实体组织成分的特点可选择不同的分散细胞的方法，以期达到单细胞产量高、细胞损伤小的目的。

实体组织 温和组织处理器 的制备方法有那几点 (1)机械法 1)用剪刀剪碎或者用锋利的解剖刀剁碎组织; 2)将剪碎的组织加入匀浆器中匀浆; 3)用吸管或注射器抽吸细胞悬液，以分散细胞;

近期，Nature Methods发表了数篇关于大规模单细胞测序相关文章，包括文库制备、测序方法、分析方法等，这里介绍其中的几篇。

去年，Broad研究所的研究人员在《Science》上发表了一种称为sNuc-Seq的单核RNA测序方法。

常规的转录组分析方法通常需要103个细胞，所以无法揭示单个细胞之间基因表达的异质性，也难以对诸如早期胚胎及异质性的组织干细胞和肿瘤干细胞等少量细胞进行分析，而单细胞转录组测序技术的出现为此提供了有效的研究工具。