单细胞高通量液滴测序Drop-seq技术是一种可快速分析数千个单细胞的方法。通过此测序方法是能够将每个细胞包裹在纳升级的微滴中,进行RNA杂交并产生MRNA转录,可进一步分析MRNA转录的起源细胞。
单细胞高通量液滴测序过程
1、准备材料
把细胞从样品组织中分离出来,制备细胞悬浮液,制备微珠悬浮液带分子条形码。
2、微滴制备
把细胞悬浮液和微珠悬浮液泵入芯片,然后与油汇合形成单独分散的微滴,用每个微珠将每个细胞包裹在同一个微滴中。
3、RNA杂交
细胞组织在微滴中裂解,释放mRNA,细胞在微珠上与分子条码杂交。
4、逆转录
为了形成mRNA逆转录物(STAMPS),裂解微滴,释放mRNA杂交物,开始逆转录。
5、PCR扩增
在核酸外切酶的作用下,切断每个MRNA逆转录物,并通过PCR扩展核酸,以扩大基因信息。
6、测序分析
采用各种生物信息学工具来对细胞生物进行测序分析。
液滴微流控是可快速分离微体积中的样本,可实现数千上万个细胞的平行高通量分析,通常每秒可产生1000个微滴,每个微滴体积为1nl;此外,在液滴微流控实验过程中是不需要使用流荧光细胞仪等实验仪器,实验操作简单、快速、便捷。
上述便是采用单细胞高通量液滴测序Drop-seq对样本组织细胞的分离过程,将其细胞在微滴中升级,进而进行杂交转录,进而可分析出转录物的起源细胞样本组织。