2016年,10x Genomics公司推出ChromiumTM系统,这是一套分子条形码和分析系统,由仪器、试剂盒和信息学软件组成,能够对接Illumina测序仪。
尽管哺乳动物胰腺的功能取决于不同细胞类型的复杂相互作用,但基因表达谱主要用大量混合物描述。从研究人员在这里以色列理工学院实施了基于液滴的单细胞RNA-seq测序方法,以确定来自四个人供体和两个小鼠品系的超过12,000个个体胰腺细胞的转录组。
细胞可分为15个簇,这些簇与先前表征的细胞类型相匹配:所有内分泌细胞类型,包括稀有ε细胞; 外分泌细胞类型; 血管细胞; 施万细胞; 静止和活化的星状细胞; 和四种类型的免疫细胞。研究人员检测了具有不同表达谱的导管细胞亚群,并用免疫组织化学染色法验证了它们的存在。此外,在人类β细胞中,他们检测到与功能成熟和ER应激水平相关的基因调控的异质性。他们使用单细胞数据对大量基因表达样本进行去卷积,以检测与疾病相关的差异表达。该数据集为发现新的细胞类型特异性转录因子,信号传导受体和医学相关基因提供了资源
诚邀各大测序公司及技术服务公司一起合作,为单细胞测序的发展贡献力量。有合作意向请拨打:021-57790908,邮箱:zhujianming0374@163.com
转摘请注明出处:谢谢配合